{"id":1250,"date":"2021-03-19T16:12:28","date_gmt":"2021-03-19T19:12:28","guid":{"rendered":"http:\/\/datamining.dc.uba.ar\/predictivos\/?p=1250"},"modified":"2021-03-19T16:12:28","modified_gmt":"2021-03-19T19:12:28","slug":"competencia-de-extraccion-de-informacion-de-informes-de-radiologia-en-espanol-spradie","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/datamining.dc.uba.ar\/predictivos\/?p=1250","title":{"rendered":"Competencia de extracci\u00f3n de informaci\u00f3n de informes de radiolog\u00eda en espa\u00f1ol (SpRadIE)"},"content":{"rendered":"<p><strong>*** Llamada para participaci\u00f3n en SpRadIE:\u00a0<\/strong><strong>Competencia<\/strong>\u00a0<strong>de extracci\u00f3n de informaci\u00f3n de informes de radiolog\u00eda en espa\u00f1ol (CLEF EHealth 2021. Tarea 1) ***<\/strong><\/p>\n<p><strong>Reconocimiento de entidades nombradas y marcadores de modalidad<\/strong>\u00a0en informes radiol\u00f3gicos escritos en espa\u00f1ol<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/sites.google.com\/view\/spradie-2020\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/sites.google.com\/view\/spradie-2020<\/a><\/p>\n<p>Estamos organizando SpRadIE, la primera tarea compartida centrada espec\u00edficamente en el reconocimiento de entidades nombradas y en la detecci\u00f3n de marcadores de modalidad (<em>hedges)<\/em>\u00a0en registros cl\u00ednicos escritos en espa\u00f1ol, espec\u00edficamente informes radiol\u00f3gicos. SpRadIE es parte de la iniciativa CLEF eHealth 2021 (Tarea 1).<\/p>\n<p><strong><a href=\"https:\/\/datamining.dc.uba.ar\/predictivos\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/Spradle-loguito.png\"><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"alignleft wp-image-1251\" src=\"https:\/\/datamining.dc.uba.ar\/predictivos\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/Spradle-loguito.png\" alt=\"\" width=\"337\" height=\"253\" srcset=\"https:\/\/datamining.dc.uba.ar\/predictivos\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/Spradle-loguito.png 960w, https:\/\/datamining.dc.uba.ar\/predictivos\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/Spradle-loguito-300x225.png 300w, https:\/\/datamining.dc.uba.ar\/predictivos\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/Spradle-loguito-768x576.png 768w\" sizes=\"(max-width: 337px) 100vw, 337px\" \/><\/a>Informaci\u00f3n importante<\/strong><\/p>\n<p>1.\u00a0<a href=\"https:\/\/sites.google.com\/view\/spradie-2020\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Sitio web de SpRadIE<\/a>, informaci\u00f3n y descripci\u00f3n detallada<\/p>\n<p>2.\u00a0<a href=\"https:\/\/clef2021-labs-registration.dei.unipd.it\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Inscripci\u00f3n a SpRadIE (Tarea1 de CLEFeHealth)<\/a>. Hay que inscribirse para poder participar!<\/p>\n<p>3. Conjunto de entrenamiento y desarrollo. Para obtenerlo, hay que llenar el siguiente\u00a0<a href=\"https:\/\/docs.google.com\/forms\/d\/e\/1FAIpQLSeaB9qHiA7Yh7G-lfdMAzxGiN0-qxYEH0-MZ_TXNgvuYzxgKg\/viewform\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">formulario<\/a>\u00a0y tomar nota de la URL que se provee al final.<\/p>\n<p>4. Scripts de evaluaci\u00f3n:\u00a0<a href=\"https:\/\/drive.google.com\/file\/d\/1s6o9L9DEfZuJF7gnlkHBomEzKzgRhKfn\/view\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">aqu\u00ed<\/a>.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>Motivaci\u00f3n de la tarea<\/strong><\/p>\n<p>El constante crecimiento de la digitalizaci\u00f3n de datos cl\u00ednicos, principalmente en formato textual, ha motivado un aumento de la atenci\u00f3n prestada a las tareas de extracci\u00f3n de informaci\u00f3n en textos biom\u00e9dicos (BioNLP). Esta informaci\u00f3n permite la mejora de los procesos sanitarios y de toma de decisiones.<\/p>\n<p>Entre otras dificultades, la extracci\u00f3n de informaci\u00f3n en el \u00e1mbito cl\u00ednico tiene que lidiar con vocabulario local y altamente especializado, con abundancia de abreviaturas no est\u00e1ndares y ambiguas y oraciones de estilo telegr\u00e1fico. Adem\u00e1s, la existencia de datos anotados de acceso p\u00fablico es escasa, debido al costo asociado a su anotaci\u00f3n y por tratarse de datos sensibles.<\/p>\n<p>El espa\u00f1ol es el segundo idioma en t\u00e9rminos de n\u00famero de hablantes nativos en el mundo y los informes cl\u00ednicos en los pa\u00edses de habla hispana est\u00e1n escritos en espa\u00f1ol. Sin embargo, existe poco trabajo sobre la extracci\u00f3n de informaci\u00f3n de los informes m\u00e9dicos escritos en dicho idioma.<\/p>\n<p>Para la extracci\u00f3n de informaci\u00f3n en informes m\u00e9dicos, es fundamental el reconocimiento de entidades nombradas y de marcadores de modalidad. En esta competencia, proponemos la identificaci\u00f3n de las principales entidades nombradas presentes en los informes radiol\u00f3gicos escritos en espa\u00f1ol. Por otro lado, m\u00e1s del 50% de los hallazgos cl\u00ednicos mencionados en los informes est\u00e1n negados o puestos en duda. Por lo tanto, la identificaci\u00f3n de marcadores de modalidad tambi\u00e9n es de suma importancia.<\/p>\n<p>Mediante esta tarea, compartimos nuestros datos anotados con el fin de difundir la existencia de este problema, y de animar a los investigadores y estudiantes a aportar soluciones creativas, y as\u00ed, poder avanzar en la extracci\u00f3n de informaci\u00f3n en textos escritos en espa\u00f1ol en el \u00e1rea de dominio biom\u00e9dico.<\/p>\n<p><strong>Fechas importantes<\/strong><\/p>\n<p>15 de Febrero de 2021: Publicaci\u00f3n del corpus de entrenamiento<\/p>\n<p>15 de Marzo de 2021: Publicaci\u00f3n del corpus de desarrollo<\/p>\n<p>15 de Marzo de 2021: Publicaci\u00f3n de los scripts de evaluaci\u00f3n<\/p>\n<p>16 de Abril de 2021: Publicaci\u00f3n del corpus de test<\/p>\n<p>30 de Abril de 2021: Cierra la inscripci\u00f3n<\/p>\n<p>1 de Mayo de 2021: Fecha l\u00edmite para el env\u00edo de resutados<\/p>\n<p>14 de Mayo de 2021: Publicaci\u00f3n de resultados<\/p>\n<p>26 de Mayo de 2021: Fecha l\u00edmite para el env\u00edo de los art\u00edculos cient\u00edficos (papers) de los participantes<\/p>\n<p>11 de Junio de 2021: Notificaci\u00f3n de aceptaci\u00f3n de los papers de los participantes [CEUR-WS]<\/p>\n<p>2 de Julio de 2021: Copia de\u00a0<em>camera ready\u00a0<\/em>de los papers de los participates<\/p>\n<p>Septiembre: Sesi\u00f3n de CLEF eHealth 2021. Un d\u00eda de duraci\u00f3n.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>Para obtener mayor informaci\u00f3n de fechas, por favor chequear el sitio de CLEF eHealth:<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/clefehealth.imag.fr\/?page_id=608&amp;\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/clefehealth.imag.fr\/?page_id=608&amp;<\/a><\/p>\n<p><strong>Publicaciones<\/strong><\/p>\n<p>Los participantes del desaf\u00edo est\u00e1n invitados a enviar la descripci\u00f3n y los resultados de sus sistemas para que se publiquen en las actas de CLEF eHealth. Habr\u00e1 un workshop en CLEF eHealth, donde los equipos participantes podr\u00e1n presentar sus soluciones y resultados.<\/p>\n<p><strong>Organizadores<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li><strong>Viviana Cotik<\/strong>, Universidad de Buenos Aires (UBA), ICC CONICET, Argentina<\/li>\n<li><strong>Laura<\/strong>\u00a0<strong>Alonso Alemany<\/strong>, Universidad Nacional de C\u00f3rdoba (UNC), Argentina<\/li>\n<li><strong>Roland Roller<\/strong>, Deutsches Forschungszentrum f\u00fcr K\u00fcnstliche Intelligenz (DFKI), Germany<\/li>\n<li><strong>Franco Luque<\/strong>, Universidad Nacional de C\u00f3rdoba (UNC), CONICET, Argentina<\/li>\n<li><strong>Jorge Vivaldi<\/strong>, Universidad Pompeu Fabra, Spain<\/li>\n<li><strong>Dar\u00edo Filippo<\/strong>, Hospital \u00abProf. Dr. Juan P. Garrahan\u00bb, Argentina<\/li>\n<\/ul>\n<p>Foro:\u00a0<a href=\"mailto:SpRadIE@googlegroups.com\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">SpRadIE@googlegroups.com<\/a><\/p>\n<p>Lista de mail de los organizadores:\u00a0<a href=\"mailto:SpRadIEOrganizers@googlegroups.com\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\"><u>SpRadIEOrganizers@googlegroups.com<\/u><\/a><\/p>\n<p>Twitter: @rad_ie<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>SpRadIE convoca a la participaci\u00f3n en su challenge. Es la primera tarea compartida centrada espec\u00edficamente en el reconocimiento de entidades nombradas y en la detecci\u00f3n de marcadores de modalidad en registros cl\u00ednicos escritos en espa\u00f1ol, espec\u00edficamente informes radiol\u00f3gicos.<\/p>\n","protected":false},"author":4,"featured_media":1252,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_mi_skip_tracking":false},"categories":[24,34],"tags":[21,35],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/datamining.dc.uba.ar\/predictivos\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1250"}],"collection":[{"href":"https:\/\/datamining.dc.uba.ar\/predictivos\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/datamining.dc.uba.ar\/predictivos\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/datamining.dc.uba.ar\/predictivos\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/4"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/datamining.dc.uba.ar\/predictivos\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=1250"}],"version-history":[{"count":2,"href":"https:\/\/datamining.dc.uba.ar\/predictivos\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1250\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1254,"href":"https:\/\/datamining.dc.uba.ar\/predictivos\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1250\/revisions\/1254"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/datamining.dc.uba.ar\/predictivos\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/media\/1252"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/datamining.dc.uba.ar\/predictivos\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=1250"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/datamining.dc.uba.ar\/predictivos\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=1250"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/datamining.dc.uba.ar\/predictivos\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=1250"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}